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Done potencia informática proyecto COVID-PHYM

3D medical animation coronavirus structure
 
El CSIC e Ibercivis lanzan un proyecto de ciencia ciudadana que busca fármacos contra el coronavirus.Cualquier persona puede colaborar desde casa dejando que su ordenador realice operaciones de cálculo. El objetivo es estudiar si medicamentos ya usados contra el ébola o la gripe logran inhibir la replicación del virus.
Acerca del proyecto
  • Cualquier persona puede colaborar desde casa descargando un programa informático y dejando que su ordenador realice operaciones de cálculo.
  • El objetivo es estudiar si medicamentos ya usados contra el ébola o la gripe logran inhibir la replicación del virus.
  • Los ordenadores de los voluntarios formarán una red de computación distribuida con una potencia de cálculo similar a la de un supercomputador.
En articulo anterior, Done potencia informática a Folding@Home, compartimos un proyecto de investigación y simulación sobre como se plegaban las proteínas y asi encontrar inhibidores para su propagación. En esta pandemia que nos ha tocado pasar la mayoría de los recursos se centran en buscar una cura al Coronavirus (COVID-19). Un proyecto español  esta realizando simulaciones como se comporta el virus al interactuar con medicamentos usados con medicamentos utilizados para combatir virus similares. Estas simulaciones requieren de muchas horas de calculo. O tenemos un superordenador o utilizamos la computación distribuida.
El proyecto que encabeza por la fundación Ibercivis:

es una fundación privada sin ánimo de lucro que tiene como objetivos realizar, promover y visibilizar la Ciencia Ciudadana.

Nuestra Misión:
  • Para la consecución de sus objetivos, y en colaboración con diversos agentes científicos y sociales, la Fundación Ibercivis:
  • Promueve investigaciones en muy diferentes áreas de conocimiento científico en los ámbitos local, nacional e internacional.
  • Proporcionar apoyo técnico, difusión y formación de modo que cualquier persona pueda participar en la investigación científica, en función de sus intereses y capacidades siempre dinámicas.
 
Para realizar estas simulaciones compartidas utilizan el gestor de proyectos de computación distribuida BOINC.


Wikipedia: La Infraestructura Abierta de Berkeley para la Computación en Red (en inglés Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), o BOINC por sus siglas en inglés, es una infraestructura para la computación distribuida, desarrollada originalmente para el proyecto SETI@home, pero que actualmente se utiliza para diversos campos como física, medicina nuclear, climatología, etc. La intención de este proyecto es obtener una capacidad de computación enorme utilizando computadores personales alrededor del mundo. Los proyectos en los que trabaja este software tienen un denominador común, y es que requieren una gran capacidad de cálculo.
 Para colaborar en el proyecto descargaremos la aplicación que corresponda al nuestro sistema operativo. Descargar aqui

En distribuciones Linux basados en Debian, la aplicación se encuentra en los repositorios oficiales, para su instalación podemos instalarlo desde la linea de comandos o desde Gestor de Software:

sudo apt-get install boinc-client boinc-manager

Gestor de Programas
 
 
Lanzamos la aplicación. Nos registramos si aun si somos usuarios nuevos y nos mostrará un listado de los proyectos a los que queremos colaborar, nosotros ingresaremos en el apartado.
Url del proyecto: https://boinc.ibercivis.es
 

Elegimos proyecto

Iniciamos nuestra colaboración

 
 Podremos controlar el uso de nuestra CPU. De forma predeterminada ocupara el tiempo que nuestro ordenador se encuentra desocupado. Esta configuración podemos cambiarla, así como colaborar con otros proyectos.

Done potencia informática a Folding@Home

Folding@Home es un proyecto de computación distribuida diseñado para usar los recursos de ordenadores personales para realizar simulaciones de plegamiento proteico. Las simulaciones precisas de cómo se pliegan las proteínas permiten a la comunidad científica comprender mejor el desarrollo de muchas enfermedades, como el alzheimer, la fibrosis quística, la enfermedad de las vacas locas o el cáncer. Hasta el momento, el proyecto folding@home ha tenido éxito simulando el plegamiento en un rango de 5-10 microsegundos, una escala de tiempo miles de veces más grande de lo que había sido posible anteriormente. 
La iniciativa colaborativa Folding@Home se está utilizando para investigar el COVID-19 y obtener información científica sobre posibles inhibidores del virus. Mucha gente esta compartiendo el calculo matematico de sus ordenadores a este proyecto, que esta superando la capacidad de las supercomputadoras más potentes.




Recuerdo haber participado en el proyecto SETI@HOME, en el cual realizaba los cálculos en busca de vida extraterrestre cuando se activaba el salvapantallas. Alguna vez me quedaba mirando, esperando que en algún momento apareciera un mensaje diciendo que en el paquete de frecuencias que mi ordenador estaba analizando, había sido encontrada vida extraterrestre. Por supuesto nunca apareció dicho mensaje .

SETI@HOME


Summit es un superordenador que tiene la capacidad de realizar 200.000.000.000.000.000 operaciones por segundo (200 petaflops).
En el proyecto Folding@Home han llegado a tener una capacidad de realizar 1.282.301.000.000.000.000 operaciones por segundo  (1.282,301 petaflops)

Estadisticas sistemas operativos


  Operaciones por segndopetaflops Numero de CPU 
 
Summit
200.000.000.000.000.000  2009.216 
 Folding@Home1.282.301.000.000.000.000 1.282,301  1.741.531


Todo estos calculos que se estan generando por la donacion de muchas personas que estan cediendo sus ordenadores, se comparten de forma gratuita para enriquecer otros proyectos:

1. Done potencia informática:
Descargar Folding @ home y ayudarnos a ejecutar simulaciones es la forma principal de contribuir. ¡Estos cálculos son enormes y cada poquito ayuda! Cada simulación que ejecutes es como comprar un boleto de lotería. Cuantos más boletos compremos, mayores serán nuestras posibilidades de ganar el premio gordo. Por lo general, su computadora nunca estará inactiva, pero hemos tenido una respuesta tan entusiasta a nuestro trabajo COVID-19 que verá un tiempo de inactividad intermitente a medida que avanzamos para configurar más simulaciones. ¡Por favor se paciente con nosotros! Hay mucha ciencia valiosa por hacer, y la estamos ejecutando lo más rápido posible.
Si quieres contribuir, puedes descargar la aplicación que se adapte a tu sistema operativo y arquitectura 
Windows
Linux
Mac
Nos permitirá que el programa corra en paralelo con el trabajo que estemos realizando, pudiendo elegir que consumo le concedemos de nuestra CPU; dependiendo de la carga del mismo que tengamos en ese momento.